员工与单位发生劳动纠纷后，申请司法加入是否有效？这个很难一概而论，因为每一起劳动纠纷的诉求不一样，每一起劳动诉求中的证据收集是否完善的情况不一样，所以导致申请司法加入后的劳动纠纷，其后续结果也是不一样的。但是一般而言，只要证据确凿，理由充分，符合国家法律法规，那么劳动纠纷中，员工申请司法加入还是有用的，这个司法加入，主要说的是劳动仲裁和法院判决。

举一个例子，我单位原先有一个小集体，小集体的员工属于单位照顾职工家属而招聘的，这些小集体工人都已经参加工作十几年了，但是单位没有给他们缴纳养老保险金，也没有给他们一个正式的名分，这里边某个人临退休年龄，结果连退休的资格都没有，他就到劳动局去问了，劳动局说你们单位既没有给你交过养老保险，也没有用工证明，那怎么给你办退休手续呢？

劳动局的回复使他感到很憋屈，就到单位去问领导，领导的答复是：“你们厂属小集体，当初仅仅是为了解决职工家属的就业吃饭问题，属于内部招工，不享受养老保险退休这一类的福利”。

这下闹大了，因为属于小集体性质的有十多个人，他们就推举了几个有点法律知识的人，到劳动局上诉，要求给他们的劳动资格做一个认定，就是说要求他们认定个人与单位之间的事实劳动合同，以解决他们今后的退休问题。劳动局的回答是：“你们这种情况，我们也很同情，工作了十几年居然不能办退休，但是目前没有解决的先例，如要解决，需要走司法程序。这就要先到法院起诉单位，确定你们的用工性质以及工龄认定，有法律判决事实劳动关系成立，然后补交这些年的养老退休金，之后才能办理退休手续”。

在得到劳动局这个需要走司法程序的答复之后，这些小集体工人就委托律师，先是收集相关证据，这些证据主要是考勤卡、工资条、工作证、工作服等，收集这些证据的作用，目的是确定单位与小集体员工有事实劳动关系。

这场司法加入的劳动纠纷拉剧了好几年，最后以工人的胜诉为结果。这样看来，在劳动纠纷中只要证据确凿，具有法律法规依据，那么胜诉的概率还是很大的。