集菌仪过滤速度慢可能由以下几个原因导致：

一、滤膜问题

滤膜孔径过小：如果选择的滤膜孔径过小，会增加过滤阻力，从而导致过滤速度变慢。例如，在过滤较大颗粒的样品时，使用了孔径过小的滤膜。

滤膜堵塞：滤膜在使用过程中可能会被样品中的杂质、颗粒物等堵塞，影响过滤速度。比如，过滤含有较多黏性物质的样品时，容易造成滤膜堵塞。

二、样品性质

样品浓度过高：样品中待过滤物质的浓度过高，增加了过滤的难度，导致速度下降。比如，微生物浓度过大的液体样品。

样品黏性较大：黏性较大的样品在通过滤膜时阻力增加，减缓过滤速度。例如，某些含有高分子聚合物的样品。

三、仪器故障

真空泵性能下降：真空泵是提供过滤动力的关键部件，如果真空泵性能不佳，如吸力减弱，会导致过滤速度变慢。

管路漏气：集菌仪的管路如果存在漏气情况，会影响真空度，进而降低过滤速度。

四、操作不当

过滤压力设置不合理：压力过高或过低都可能影响过滤速度。

安装滤膜不正确：滤膜安装不紧密、有褶皱等，会影响过滤效果和速度。

综上所述，集菌仪过滤速度慢可能是由滤膜、样品、仪器或操作等多方面的因素引起的。需要对具体情况进行仔细分析和排查，以确定准确的原因并采取相应的解决措施。