万历皇帝的一生，基本上可以概括为张居正和争国本。前半生他和张居正三个字脱不了干系，生活在张居正的阴影之下，后半生他基本上陷入争国本的旋涡之中。争国本主要是他想要“废长立爱”，说的是他不想里庶长子朱常洛为太子，心中得意的人选是他的宠妃郑贵妃所生朱常洛为太子，遭到了众臣的反对。万历皇帝长达几十年都在这件事上徘徊，甚至一度将他的内阁首辅给被迫辞职了。这一位内阁首辅的名字叫做申时行。
申时行这一位内阁首辅十分的有名气，因为他曾经是嘉靖年间的状元，状元是多少人梦寐以求的事情，当时直接被授予编撰，这是清贵的官员，后来说到张居正的赏识逐渐升迁 ，在万历六年的时候，申时行终于成功入阁，参赞阁务。
申时行，字汝默，长洲人。嘉靖四十一年进士第一。授修撰。历左庶子，掌翰林院事。万厉五年，由礼部右侍郎改吏部。时行以文字受知张居正，蕴藉不立崖异，居正安之。六年三月，居正将归葬父，请广阁臣，遂以左侍郎兼东阁大学士入预机务。已，进礼部尚书兼文渊阁，累进少傅兼太子太傅、吏部尚书、建极殿。——《明史》.卷二百十八·列传第一百六.申时行传
此后申时行在内阁中开始站稳了脚步，张居正去世后，他张四维成为内阁首辅，他升任内阁次辅，张四维丁忧后，他成为了内阁首辅，成为万历朝第四任内阁首辅。
四维忧归，时行为首辅。——《明史》.卷二百十八·列传第一百六.申时行传
至于申时行前面的三任首辅，高拱、张居正和张四维，都是强势之人，但是张四维却是一个老好人，自己当了内阁首辅还是一团和气，当时有三个人上书说申时行的儿子科考有情弊，上书弹劾，将申时行的姻亲给罢免了，申时行最后也将这三人给贬官，不过不就之后就给他们升官，所以人们都说申时行是忠厚之人。
初，御史魏允贞、郎中李三才以科场事论及时行子用懋，贬官。给事中邹元标劾罢时行姻徐学谟，时行假他疏逐之去。已而占物情，稍稍擢三人官，三人得毋废。世以此称时行长者。——《明史》.卷二百十八·列传第一百六.申时行传
申时行一辈子小心翼翼，在朝堂之上承帝心，下顺百官，皇帝对他也十分满意，百官认为此人软弱，不过他们也不希望有一个强势的首辅就像张居正那样，他们还怎么玩呢？但是就这样一位首辅确因为这件却因为立太子一事被迫辞职了。
身为内阁首申时行早在万历十四年的时候，带着群臣上书要万历皇帝立皇长子为太子，毕竟皇长子已经五岁了，而且郑贵妃生下皇三子朱常洵，让万历十分喜欢，甚至有夺嫡的意思，所以申时行带着众人要求皇帝确定储君之位，但是被万历皇帝直接给拒绝了。
十四年正月，光宗年五岁，而郑贵妃有宠，生皇三子常洵，颇萌夺嫡意。时行率同列再请建储，不听。——《明史》.卷二百十八·列传第一百六.申时行传
万历十八年（1580年）初，此时的皇长子按照足岁已经七岁办，如果按照虚岁来算已经快九岁了，可是还没有出阁讲学，因为这是太子和文官接触的第一步，在很多大臣眼里皇长子朱常洛就是太子，就是下一任的皇帝，现在已经这么大了，还没有出阁讲学不正常。
而且出阁讲学必须以太子的名义，其实大臣们就是想让皇帝承认皇长子的太子地位，皇帝也受不了群臣的上书，于是正月初一在毓德宫接见了申时行等内阁大臣，趁着这个机会申时行就万历皇帝说：“皇长子已经九岁了，内外都以为早册立他为皇太子！”万历一看内阁首辅申时行这样说了，肯定不是他一个人的意思，他是代表内阁和大臣而来的，于是他说：‘知道，我没有嫡子，自古长幼自有定序，皇长子年纪太小，禁不起各种典礼的折腾，等他长大只有后再行册立吧。’
申时行知道这是皇帝的托词，可是他也没有办法，皇帝这样说了，内阁大臣也在，就等于是承认了要立皇长子，既然你现在不想立，那好，就让皇长子出阁读书吧，一旦让皇长子出阁读书就等于承认了长子就是太子。万历一听不耐烦了，直接说我知道了，你们回内阁吧。万历皇帝还是只说皇长子年纪小，连出阁讲学都不提了。
八年，帝召皇长子、皇三子，令时行入见毓德宫。时行拜贺，请亟定大计。帝犹豫久之——《明史》.卷二百十八·列传第一百六.申时行传
十八年春正月甲辰朔，召见大学士申时行等于毓德宫，出皇长子见之。——《明史》.卷二十·本纪第二十·神宗一
其实申时行也看出来，皇帝嘴上这样说，但是内心根本不想立皇长子，但是内阁几个大臣都在，皇帝你说出来的话不能不算数吧，于是在正月底，申时行正式上书请求皇帝亲自选定皇长子出阁读书的日期，结果万历皇帝是直接拒绝了。
这件事出来之后京城中的大臣都知道了皇帝这是不想立长子了，于是他们向内阁施加压力，想要以此来要挟皇帝屈服。申时行身为内阁首辅被大臣们逼迫的没有办法，于是带着其他三个内阁大臣，直接给皇帝说，百官逼迫，皇帝你不立皇长子，我们没有办法向百官交代，于是直接辞职，这样对皇帝对百官都有交代。这一举动让万历吓坏了你们辞职了，谁干活，没有办法最后他只得说好还。
下诏曰：“朕不喜激聒。近诸臣章奏概留中，恶其离间朕父子。若明岁廷臣不复渎扰，当以后年册立，否则俟皇长子十五岁举行。”时行因戒廷臣毋激扰——《明史》.卷二百十八·列传第一百六.申时行传
你们都不要说，我反感，等到皇长子十五岁，也就是万历二十年我就册立他为皇太子，这样行了吧，虽然没有得到想要的结果，但是君无戏言呀，这样的大臣们才消停，申时行也让大臣们不要再说了，免得皇帝反感，他带着内阁阁臣回去办公了。
内阁和大臣们算是取得了阶段性胜利，皇帝毕竟低头了，申时行也比较很高兴，毕竟代表着内阁，让皇帝屈服了，不过申时行想不到身为大佬的皇帝居然会耍赖，光明正大耍赖。
起因是有一个官员看皇帝约定的日期快到了，于是就皇上改册立皇太子了，这是善意的提醒，皇帝你不要忘记了，可是皇帝一反常态，勃然大怒。万历皇帝说我早就说了不准臣下在一年之内再说这件事，你们这是违反了我的旨意，是你们违反在先，立太子之事延期一年。
明年八月，工部主事张有德请具册立仪注。帝怒，命展期一年。——《明史》.卷二百十八·列传第一百六.申时行传
这皇帝明明显的是耍无赖，申时行知道后，直接懵逼了，这皇帝怎么这个德行呀，这简直不拿自己当一回事了。内阁也不得不做出来决定，于是内阁几个大臣联名奏请明春册立太子。不过草拟这奏章的人是内阁次辅许国，但是他把申时行的名字放在了最前面，因为申时行是内阁首辅。
而内阁中亦有疏入。时行方在告，次辅国首列时行名。——《明史》.卷二百十八·列传第一百六.申时行传
万历皇帝是接到奏章的时候大怒，这内阁要罢工不成，和稀泥的申时行知道皇帝的震怒，立刻上了一道揭帖，为自己辩白，说我虽然名字在其中，但是这件事我不知道，完全和我没有关系。
时行密上封事，言：“臣方在告，初不预知。册立之事，圣意已定。有德不谙大计，惟宸断亲裁，勿因小臣妨大典。”——《明史》.卷二百十八·列传第一百六.申时行传
这揭帖一般都是君臣之间的小秘密，要不然申时行也不会用揭帖，接到申时行的揭帖，万历皇帝怒气稍微消，他也知道申时行的为人，应该和他没有关系，他这一高兴将揭帖传给了内阁，被次辅许国看到了。
面对首鼠两端的申时行，许国毫不客气地将它送交给事中抄录公布。时舆论为之哗然， 说申时行是个地道的两面派和卖友误君的小人，即便皇帝对之不加处罚，洪武皇帝的神灵也会诛载他的。群臣也开始弹劾这一位不干实事的内阁首辅，无奈之下申时行只得请求归养。
于是给事中罗大纮劾时行，谓阳附群臣之议以请立，而阴缓其事以内交。中书黄正宾复论时行排陷同官，巧避首事之罪。二人皆被黜责。御史邹德泳疏复上，时行力求罢。诏驰驿归。——《明史》.卷二百十八·列传第一百六.申时行传
申时行辞职报告万历皇帝也获得批准，而次辅许国也因此辞职，这件事终于以两个内阁大臣辞职而暂时告一段落。
至于申时行这个内阁首辅为什么辞职，天枫说认为他也有难处。
申时行生性柔和，是一个老好人，他在内阁首辅的位置上，也不容易，多次申请册立皇太子，万历都不准许，也知道了皇帝的态度了，于是不再力劝皇帝，但是大臣们不愿意，你这个内阁首辅要带头呀，于是他在大臣和皇帝之间开始周旋，既不愿意得罪皇帝也不愿意得罪大臣么。
可是这种这种态度让大臣们不满，加上秘揭的事情暴露，让他再臣僚面前威信扫地，再也颜面担任内阁首辅的之职了。
对于皇帝来说这一位老好人内阁首辅是最佳人选，可惜的是申时行已经触犯众怒了，想挽留申时行也会留下的，因为立太子的事情申时行和许国两位内阁大臣辞职，直到万历二十二年，万历皇帝才准许皇长子出阁讲学，距离这件事已经过去了三年，申时行可谓是牺牲皇帝和大臣们斗争的牺牲品。
