1958年随着青岛海军政治学校撤销后，担任校长的吴西将军等待着组织上的通知。

不久后军委海军干部部派人找吴西将军谈话，要将他分配到海军当检察长。对于组织上的决定，吴西将军是无条件服从的：“不管官大官小，有工作干就行。”

在等待组织上正式下命令期间，吴西将军便提前到岗了，去了解情况，为自己日后的工作好奠定基础。

吴西将军到职后，就参加了由检察院、法院和保卫部召开的会议，总结一年的工作，布置今后的工作。对于自己的这个岗位，吴西将军有着清晰的认知：要实事求是地断案，不冤枉一个好人，同样也不放走一个坏人！

吴西将军是这样说，同样是这样去做的。在吴西将军担任检察长的一年时间里，他处理了很多案件。由于吴西将军注重调查研究，从不轻信汇报，这也使得经他手的案件，定性准确，证据确凿，令人心服口服。

吴西将军在工作中所展现出的能力，也是得到上级领导的认可。在1959年下半年，吴西将军被调到海军后勤部当副政委。

在当时的时代背景下，后勤部的工作是不好干的，为能够保证部队的战斗力，吴西将军和其他领导同志想了许多办法。比如说，动员大家利用房屋前后的空地，去种点蔬菜或者粮食。

在副政委这个岗位上，吴西将军还是作出一番成绩的。

1964年，时年64岁的吴西将军正准备大展身手时，却突然接到组织上让他离休的命令。用吴西将军的话来讲：

组织通知我离休的命令，象一声响雷，震惊了正在全力以赴抓工作的我，使我心中很不平静，夜不能眠。经过痛苦的思想斗争，从有意见、不理解，逐步转过思想弯子，认识到这是大势所趋，只有服从组织决定。

就这样，吴西将军离开了几十年紧张而有序的军队生活，开始了自己长达41年的离休生活。

那时候吴西将军还算“年轻”，为此他决定根据自己的实际情况，做一些力所能及的为人民服务的工作。他每天早上五点起床，然后锻炼身体，吃过早饭后，就开始学习。

吴西将军喜欢阅读，除去传阅的中央文件、内部参考等材料外，他还会去看看当天的报纸，争取做到关心国家大事，思想跟上形势。下午的时候，吴西将军会睡个午觉，练练书法，一天也是过得非常充实。

1965年随着又有一些老干部离休了，为此海军也专门成立了离职干部休养所，吴西将军担任支部书记。在这项工作岗位上，吴西将军主要是抓三件事：

第一，坚持学习制度，及时传达中央文件和上级指示精神，在个人阅读的基础上，组织集体讨论，深刻领会文件精神；第二，教育好子女，要求老同志从政治上关心子女的成长，使他们好好学习，好好工作，接好革命班，不要做不正当的事；第三，健全组织生活，定期召开党小组会和支部大会，及时交流思想，加强组织纪律观念……

1969年随着局势的发展变化，海军干休所的干部大部分被疏散到浙江江山。吴西将军便向组织上提出请求，想要到保定去，没过多久便得到了批准。来到保定后，吴西将军在老战友的关心下，他的生活还是比较稳定的。

在保定干休所的时候，吴西将军又当选为干休所支部书记。这个工作是费力不讨好的，很多同志怕得罪人，不敢干。唯独吴西将军不担心这一点，他做人做事都始终秉持公正之心，敢于批评不正之风，为此很多同志都很信服他。

1975年吴西将军和他的老战友相继回到北京。回京后，吴西将军也是向组织上反映，希望能给安排点工作。中央领导考虑到吴西将军的情况后，便让他将红七红八军仍健在的同志的姓名，在什么地方，做什么工作，想办法统计下，同时告诉他要好好写革命回忆录。

吴西将军在收到组织上的指示后，也是立即忙碌了起来。进过走访以及老战友的帮主，吴西将军也是圆满的将这项任务给完成了。在余下的岁月中，吴西将军便开始准备写回忆录，想要将自己一生的革命经历写下来，留给后人学习。

2005年7月21日，吴西将军在北京逝世，享年105岁。

吴西将军从1964年离休，到2005年逝世，离休生活长达41年。在这么长的离休岁月中，吴西将军始终坚持为人民服务的信念，为国家和军队的建设发展贡献了自己的一份力。