新中国成立后，由李克农领导的社会部改编为情报部，他继续担任部长，但作为副部长的欧阳毅被告知，这里的工作已经不合适他了。

欧阳毅是一位儒将，土地革命时期担任过军区保卫局局长，职务并不低。保卫局顾名思义，就是政治侦察、刑事侦查、预审、治安管理、安全保卫，更像是如今的内卫与国安的工作。

抗战时期的他，被安排到抗大工作，因身体不好长期休养，尽管此后也被安排职务，实际上工作少，休养多。解放战争时，从延安转入晋绥后，抵达晋察冀中央工委所在地西柏坡住下，因为有肺病等，无法担负大量工作，考虑到他过去担任过保卫工作，安排他担任社会部副部长，协助李克农。

社会部不仅负责情报工作，还负责刑事侦查、预审、治安管理、安全保卫等。

可欧阳毅只是挂职，并没有投入实际工作中，因身体不好被李克农安排去大连休养。直到北平和平解放后才回来。

1949年11月，社会部改为情报部和公安部，李克农担任情报部部长，罗瑞卿担任公安部部长。欧阳毅也面临职务安排，可情报部工作不适合他，过去没有干过，如今更专业。但李克农对他的工作很关心。

此时，罗荣桓想让他到最高检工作，因为过去的保卫工作，与司法等联系多，也算有点关联。可他并不愿意离开部队。遇到从东北调来担任财经秘书的李逸民，他得知公安部队组建，司令是罗瑞卿担任。

罗瑞卿过去担任抗大副校长，是李逸民和欧阳毅的老首长。他们就去找罗瑞卿，得知公安部队领导班子还没有配齐，就让他俩担任政治部主任、副主任。

公安部队隶属军委，没有地方化，而且在1955年还改为公安军，成为五大军种之一。欧阳毅在公安军工作到1957年，随着精简改革，公安军撤销，欧阳毅调去炮兵部队担任副政委。六七十年代经历一些坎坷，1975年恢复工作后，继续在炮兵工作，直到离休。