《东汉演义之三 大闹武科场》围绕王莽在长安开科选拔武状元展开，讲述了一系列精彩的比武故事以及背后的权谋斗争。

王莽开科取士，选拔武状元，众多举子齐聚长安。考试过程中，三齐王苏献之子苏天宝企图通过不正当手段夺取状元，安排数人持齐眉棍与他比试，皆被苏天宝轻松击败。邓禹看不惯苏献父子的行径，主动挑战苏天宝。起初，邓禹与苏天宝假战，在得到王莽暗示后，邓禹果断出手斩杀苏天宝。王莽本想杀邓禹，经窦融劝谏，最终将邓禹赶出考场。

岑彭本不想参加考试，却被 “坏包” 骗来。他在比武中先后战胜景丹和贾复。贾复与岑彭交战时，岑彭使用暗器，贾复也拿出 “八宝电光锤”，两人僵持不下，后吴汉一箭射断绒绳解围。王莽看中吴汉，欲招其为驸马。刘秀趁机以箭法高超为由求见王莽，企图刺杀他，却未成功。不过，在窦融和王丰的帮助下，刘秀化险为夷，被赶出考场。

最后，岑彭和马武登场比武。马武武艺高强，与岑彭难分高下。但王莽以貌取人，点岑彭为状元，马武被点为第二名。马武不服，大骂王莽是篡位国贼，并大闹武科场，就此反了。故事在此留下悬念，后续情节将在下册《遁潼关》中展开。